基因测序追踪超级细菌源头

全基因组测序技术可以帮助研究人员追踪MRSA、克雷伯氏菌等超级细菌的源头，同时也为寻找抑制它们的药物或疗法提供了线索。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、克雷伯氏菌等细菌能引起多种疾病和感染，同时各种抗生素往往又对它们无可奈何，这些令人色变的细菌因而被称为超级细菌。幸运的是，近年来，研究人员已经能用全基因组测序技术追踪这些细菌的源头，同时也为寻找抑制它们的药物或疗法提供了线索。

罗西医院的MRSA感染

2011年6月，美国马里兰州贝塞斯达国立卫生研究院（NIH）临床中心发生了克雷伯氏菌感染导致6人死亡的严重事故。该临床中心利用全基因组测序技术追踪到了克雷伯氏菌的来源。事后，英国剑桥大学微生物学家沙龙·匹考克（Sharon Peacock）对这一事件做出了积极评价：全基因组测序技术对疫情调查和监测具有潜力。

没想到匹考克等人不久就成为追踪超级细菌MRSA起源的主角。

2011年底，英国剑桥市罗西医院的医生发现，该院婴儿特别监护室中的3名婴儿相继染上MRSA。恐慌随即开始在医院蔓延。从3名婴儿身上分离出MRSA后，高度紧张的医护人员马上打扫了病房，并彻底消毒，以期切断传染源。

但是罗西医院的MRSA感染并没有就此结束。在病房杀菌消毒后几天，又有1名婴儿的MRSA检测结果呈阳性。检测结果显示，3名婴儿染上MRSA的同时，至少还有另外8名儿童感染了相似耐药性的MRSA菌株。但是，这些染上MRSA的儿童在几周内都没有出现感染症状，这似乎说明，感染这8名儿童的MRSA可能并非来自这3名婴儿或婴儿的病房。

到2012年3月，匹考克的研究小组请缨领命，试图追踪造成罗西医院广泛感染的MRSA究竟来自何处。匹考克小组对取自这所医院婴儿身上的MRSA菌株与取自其他医院成年患者相似的MRSA菌株进行全基因组测序，并进行比较，结果让人吃惊，婴儿病房的MRSA菌株与其他疑